四六時中なぞなぞのことを考えているくらいになぞなぞが大好きで、いつも母親からそのことで叱られている主人公の元に、なぞなぞが勉強するための学校「ナンゾウ小学校」の校長から手紙が届く。ナンゾウ小学校に魅力を感じた主人公がそこに転校するところからゲームが始まる。で、実はそこの校長がなぞなぞで人間を洗脳して世界征服をたくらむ悪人で……。